¿Qué tienen en común una célula cancerosa cultivada con una célula cancerosa? Muy poco



La actualidad en Alicantur Noticias

Madrid

Actualizado:

¿Qué tienen en común una célula cancerosa cultivada en laboratorio y las células cancerosas de una persona? Bueno, según un estudio publicado en
Medicina del genoma
, Muy poco.

Científicos del instituto
Medicina Johns Hopkins (Estados Unidos)
han desarrollado una nueva técnica de modelado por computadora que muestra que las células cancerosas humanas cultivadas en el laboratorio son las menos similares genéticamente a sus fuentes humanas.

El descubrimiento, dicen, debería ayudar a concentrar más recursos en modelos de investigación del cáncer, como ratones modificados genéticamente y modelos 3D de tejido humano, o tumores, para evaluar mejor la biología y los tratamientos del cáncer, así como los errores genéticos responsables del crecimiento y el progreso del cáncer. .

«Puede que no sorprenda a los científicos que las líneas de células cancerosas sean genéticamente inferiores a otros modelos», dice Patrick Cahan, autor principal del nuevo estudio.

La nueva técnica, llamada CancerCellNet, utiliza modelos informáticos para comparar las secuencias de ARN de un modelo con datos de un atlas del genoma del cáncer para comparar el nivel de concordancia de los dos modelos.

Los investigadores encontraron que, en promedio, los ratones y tumores modificados genéticamente tienen secuencias de ARN más estrechamente alineadas con los datos de referencia del atlas del genoma en 4 de los 5 tipos de tumores que probaron, incluidos los cánceres de mama, pulmón y ovarios.

Los datos se suman a la evidencia que sugiere que las líneas de células tumorales cultivadas en laboratorio tienen menos paridad con su origen humano debido a las complejas diferencias entre el entorno natural de una célula humana y los cultivos de laboratorio. «Una vez que los tumores se eliminan de su entorno natural, las líneas celulares comienzan a cambiar.Cahan aclara.

Entre los modelos de investigación del cáncer más utilizados se encuentran las líneas celulares creadas mediante la extracción de células cancerosas humanas y su cultivo con diversos nutrientes en el laboratorio.

El objetivo del nuevo trabajo fue desarrollar un enfoque computacional para evaluar modelos de búsqueda de una manera menos complicada y precisa.

Pero también se utilizan ratones que han sido modificados genéticamente para desarrollar cáncer. En otros casos, implantan tumores humanos en ratones, un proceso llamado xenoinjerto, o usan tumores.

Para evaluar qué modelo de investigación imita mejor lo que sucede en una persona, los científicos trasplantan células cultivadas en el laboratorio o células de tumores o xenoinjertos a ratones y ver si las células se comportan como deberían, es decir, crecen y se propagan. y preservar las características genéticas del cáncer. Sin embargo, los investigadores de Johns Hopkins Señalan que este proceso es caro, requiere mucho tiempo y es científicamente exigente.

El objetivo del nuevo trabajo fue desarrollar un enfoque computacional para evaluar modelos de búsqueda de una manera menos complicada y precisa.

Esto es lo que hace CancerCellNet, en el que se basa una nueva técnica información genética sobre el ARN celular, una cadena molecular de sustancias químicas similares al ADN y un conjunto intermedio de instrucciones que utilizan las células para traducir el ADN y producir proteínas.

«El ARN es un sustituto suficientemente bueno para el tipo de célula y la identidad celular, que son fundamentales para determinar si las células cultivadas en el laboratorio se parecen a sus contrapartes humanas», dice Cahan. Los datos de expresión de ARN están altamente estandarizados y disponibles para los investigadores y son menos propensos a variaciones técnicas que pueden confundir los resultados del estudio ”.

Primero, Cahan y su equipo tuvieron que elegir un conjunto estándar de datos que sirviera de base para comparar patrones de búsqueda. Los datos del
Atlas del genoma del cáncer
, que incluye información sobre la expresión de ARN de cientos de muestras de tumores de pacientes y su correspondiente estadio y grado tumoral, sirvió como entrenamiento.

Las células de cáncer de próstata de una línea llamada PC3 comienzan a parecerse genéticamente más al cáncer de vejiga

También probaron su herramienta CancerCellNet aplicándola a datos donde ya se conocía el tipo de cáncer, como el Consorcio internacional para la secuenciación del genoma humano.

Utilizaron datos del atlas del genoma como base para comparar los datos de expresión de ARN de 657 líneas de células cancerosas cultivadas en laboratorios de todo el mundo, algunas de las cuales se establecieron hace décadas, 415 xenoinjertos, 26 modelos de ratón modificados genéticamente y 131 tumores.

Por ejemplo, vieron que las células de Cancer de prostata de una línea llamada PC3 comienzan a parecerse más genéticamente al cáncer de vejiga. También es posible, dice, que la línea celular originalmente estuviera mal etiquetada o que en realidad se derivara del cáncer de vejiga.

Pero su conclusión es que, desde un punto de vista genético, la línea celular del cáncer de próstata no era un sustituto representativo de lo que sucede en un ser humano típico con cáncer de próstata.

Este experto reconoce que antes de tener una idea completa de lo que realmente hace, debe investigar más. En el futuro, dice, «exploraremos formas de mitigar este impacto, incluido el uso de antivirales, terapias con anticuerpos y vacunas».

Míralos
Comentarios

.